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从细胞生物学角度分析， 微波对微生物 (以细菌为例) 也具有生物学效应。一是细菌的细胞壁的主要成分不是纤维素， 而是肽聚糖 (N - 乙酰葡萄糖胺与 N - 乙酰胞壁酸通过α- 1 ， 4 糖苷键连接而成) 。特别是革兰氏阴性菌细菌壁内蛋白质含量较高， 在微波场中， 细胞壁发生机械性损伤， 使细胞质外漏， 影响其正常生理活动二是细菌的细胞膜是由膦脂和蛋白质组成的具有选择性的半透性膜， 它是细菌细胞与外界环境进行物质、能量信息交换的场所。细菌细胞内外存在着离子浓度梯度差，+ + +如细胞内是高 K 、低 Na ， 而外界环境则是高 Na ，+ + +低 K ， 这种离子梯度是由分布在细胞膜上的 Na ， K2 +泵逆浓度梯度主动运输来维持的，蔬菜微波干燥设备， 其它的离子如 Ca ，2 +细胞内外也存在着明显的离子浓度梯度差， 由 Ca 泵来维持。这些生物离子泵在高频率的微波场中， 将不能正常发挥其生理功能。

后来， 其它研究者还发现， 酱油经微波处理后，沧州微波干燥设备， 可以抑制霉菌的生长及杀灭肠道致病菌， 但对氨基酸态氮 无破坏作用。

此外， 用微波对牛奶杀菌消毒后， 细菌和大肠杆菌数完全达到卫生标准要求， 不仅营养成份保持不变， 而且脂肪球直径变小， 提高了产品的稳定性， 有利于人体消化和吸收。

食品包装用纸消毒的常规方法为化学或物理方法，但会损伤纸的品质， 尤其是化学方法， 因其会产生臭味而降低纸的使用价值。而紫外线杀菌， 仅能杀灭包装纸表面的大部分细菌，纸板微波干燥设备， 效果也不理想。有研究者用微波对质量3 kg、体积为15cm ×12cm ×25cm 的冰棍纸和60 g糖纸杀菌， 仅用 5 s 即能杀灭包括纸面表层的试验微生物， 无菌实验也证明效果是好的。